Не подключиться к серверу при обновлении

[dzhoser]

В source.list его нет, может попробовать оставить только main'ы без non-free?..

Попробуйте поискать в

Код Выделить Развернуть

/etc/apt/sources.list.d там будет порядка 10-20 файлов в их содержимом необходимо найти ваш репозиторий который нужно удалить. Удаление должно производится вместе с файлом.
Далее

Код Выделить Развернуть

sudo apt autoclean

Код Выделить Развернуть

sudo apt-get autoremove

Код Выделить Развернуть

sudo dpkg --configure -a

Код Выделить Развернуть

sudo apt install -f

Код Выделить Развернуть

sudo apt update && sudo apt upgrade -y

[nos]

После изменения в /etc/apt/sources.list нужно сначала сделать apt update

sudo apt-get autoremove

У меня не получается это проделать, так как сразу требует

Код Выделить Развернуть

sudo dpkg --configure -aА дальше всё останавливается на попытке подключения. apt update делал, но не помогло.

Код Выделить Развернуть

noscow@Tovaristch:~$ sudo apt-get autoremove

[sudo] пароль для noscow:

E: Работа dpkg была прервана, вы должны вручную запустить «sudo dpkg --configure -a» для устранения проблемы.

noscow@Tovaristch:~$ sudo dpkg --configure -a

Настраивается пакет libcifpp-data (5.0.7.1-1) ...
--2024-01-20 14:48:30--  https://mmcif.wwpdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx_v50.dic.gz
Распознаётся mmcif.wwpdb.org (mmcif.wwpdb.org)... 128.6.158.92
Подключение к mmcif.wwpdb.org (mmcif.wwpdb.org)|128.6.158.92|:443... соединение установлено.
HTTP-запрос отправлен. Ожидание ответа... 200 OK
Длина: 586453 (573K) [application/x-gzip]
Сохранение в: «/var/cache/libcifpp/mmcif_pdbx.dic.gz»

/var/cache/libcifpp/mm 100%[==========================>] 572,71K   854KB/s    за 0,7s   

2024-01-20 14:48:31 (854 KB/s) - «/var/cache/libcifpp/mmcif_pdbx.dic.gz» сохранён [586453/586453]

--2024-01-20 14:48:32--  https://ftp.wwpdb.org/pub/pdb/data/monomers/components.cif.gz
Распознаётся ftp.wwpdb.org (ftp.wwpdb.org)... 128.6.159.186
Подключение к ftp.wwpdb.org (ftp.wwpdb.org)|128.6.159.186|:443...
(Я удалил вообще все файлы в sources.list.d)

20 января 2024, 14:45:50

Если копию системы перед обновлением не делали, я бы переустановил раз там аж dpkg отвалился. Вообще настоятельно рекомендую перед обновлением использовать какой нибудь Timeshift для резервного копирования системы чтобы можно было откатиться.

Тоже прихожу к такой мысли. Компьютер работает, нужные файлы могу с него без проблем скопировать. Времени уже точно больше потратил на разбор проблемы, чем на переустановку системы.
Хотелось просто разобраться, как я вообще это сломал. Чтобы в дальнейшем без косяков обновляться. 

20 января 2024, 14:56:22
Понял свою ошибку, я останавливал dpkg не из-под рута.

Код Выделить Развернуть

sudo killall dpkgпомогло, правда, теперь какая-то беда с зависимостями для libreoffice. Работает вообще. Но при обновлении выдаёт жалобы.
autoremove пишет следующее:

Код Выделить Развернуть

noscow@Tovaristch:~$ sudo apt-get autoremove
Чтение списков пакетов... Готово
Построение дерева зависимостей... Готово
Чтение информации о состоянии... Готово        
Следующие пакеты будут УДАЛЕНЫ:
  libcifpp-data
Обновлено 0 пакетов, установлено 0 новых пакетов, для удаления отмечено 1 пакетов, и 4 пакетов не обновлено.
Установлено или удалено не до конца 46 пакетов.
После данной операции объём занятого дискового пространства уменьшится на 10,5 MB.
Хотите продолжить? [Д/н]
debconf: DbDriver "config": /var/cache/debconf/config.dat is locked by another process: Resource temporarily unavailable
(Чтение базы данных ... на данный момент установлено 406002 файла и каталога.)
Удаляется libcifpp-data (5.0.7.1-1) ...
debconf: DbDriver "config": /var/cache/debconf/config.dat is locked by another process: Resource temporarily unavailable
dpkg: ошибка при обработке пакета libcifpp-data (--remove):
 подпроцесс из пакета libcifpp-data установлен сценарий post-removal возвратил код ошибки 1
dpkg: слишком много ошибок — останавливаемся
При обработке следующих пакетов произошли ошибки:
 libcifpp-data
Обработка остановлена из-за слишком большого количества ошибок.
E: Sub-process /usr/bin/dpkg returned an error code (1)


[dzhoser]

Вывод полный

Код Выделить Развернуть

sudo apt update

[qupl]

Завершить все программы, которые работают с deb-пакетами (apt*, dpkg, synaptic ит.п.)

Код Выделить Развернуть

sudo dpkg -r libcifpp-dataЕсли ошибки как в последнем посте, то перезагрузиться и еще раз.

[Aalexeey]

nos, как вам здесь уже написали, прежде чем затевать что-то грандиозное как новичку сначала надо научиться сохранять то что было так дорого установленно и настроено. Для этого надо немного читать форум прежде чем влазить во все тяжкие (и главное сначала думать а потом делать), научиться делать образы рабочей и настроенной системы это первостепенная необходимость не только для linux, этот навык избавит вас от 90% проблем и сэкономит кучу времени и нервов.
Там внизу ↓

[nos]

Вывод полный

Код Выделить Развернуть

sudo apt update

Кинул под спойлер:

Открыть содержимое (спойлер)

Код Выделить Развернуть

noscow@Tovaristch:~$ sudo apt update
[sudo] пароль для noscow:
Сущ:1 https://ftp.debian.org/debian bookworm InRelease
Пол:2 https://ftp.debian.org/debian bookworm-updates InRelease [52,1 kB]
Пол:3 https://ftp.debian.org/debian bookworm-proposed-updates InRelease [59,5 kB]       
Пол:4 https://security.debian.org/debian-security bookworm-security InRelease [48,0 kB]
Пол:5 https://ftp.debian.org/debian bookworm-backports InRelease [56,5 kB]
Пол:6 https://ftp.debian.org/debian bookworm-proposed-updates/main amd64 Packages.diff/Index [63,3 kB]
Пол:7 https://ftp.debian.org/debian bookworm-proposed-updates/main Translation-en.diff/Index [63,3 kB]
Пол:8 https://ftp.debian.org/debian bookworm-proposed-updates/main amd64 Packages T-2024-01-20-2028.17-F-2024-01-20-2028.17.pdiff [15,4 kB]
Пол:8 https://ftp.debian.org/debian bookworm-proposed-updates/main amd64 Packages T-2024-01-20-2028.17-F-2024-01-20-2028.17.pdiff [15,4 kB]
Пол:9 https://ftp.debian.org/debian bookworm-backports/main amd64 Packages.diff/Index [63,3 kB]
Пол:10 https://ftp.debian.org/debian bookworm-backports/main Translation-en.diff/Index [53,2 kB]
Пол:11 https://ftp.debian.org/debian bookworm-proposed-updates/main Translation-en T-2024-01-20-2028.17-F-2024-01-20-2028.17.pdiff [9 647 B]
Пол:11 https://ftp.debian.org/debian bookworm-proposed-updates/main Translation-en T-2024-01-20-2028.17-F-2024-01-20-2028.17.pdiff [9 647 B]
Пол:12 https://ftp.debian.org/debian bookworm-backports/main amd64 Packages T-2024-01-21-2005.55-F-2024-01-20-2028.17.pdiff [1 589 B]
Пол:12 https://ftp.debian.org/debian bookworm-backports/main amd64 Packages T-2024-01-21-2005.55-F-2024-01-20-2028.17.pdiff [1 589 B]
Пол:13 https://ftp.debian.org/debian bookworm-backports/main Translation-en T-2024-01-20-2028.17-F-2024-01-20-2028.17.pdiff [151 B]
Пол:13 https://ftp.debian.org/debian bookworm-backports/main Translation-en T-2024-01-20-2028.17-F-2024-01-20-2028.17.pdiff [151 B]
Получено 486 kB за 1с (458 kB/s)
Чтение списков пакетов... Готово
Построение дерева зависимостей... Готово
Чтение информации о состоянии... Готово         
Может быть обновлён 21 пакет. Запустите «apt list --upgradable» для показа.
N: Репозиторий «Debian bookworm» изменил значение поля «firmware component» с «non-free» на «non-free-firmware»
N: Дополнительные сведения об этом можно найти в «Информации о выпуске» по адресу: https://www.debian.org/releases/bookworm/amd64/release-notes/ch-information.html#non-free-split
noscow@Tovaristch:~$

После выполнения

Код Выделить Развернуть

sudo dpkg -r libcifpp-data

Стало:

Код Выделить Развернуть

noscow@Tovaristch:~$ sudo apt update
Сущ:1 https://security.debian.org/debian-security bookworm-security InRelease
Сущ:2 https://ftp.debian.org/debian bookworm InRelease
Сущ:3 https://ftp.debian.org/debian bookworm-updates InRelease
Сущ:4 https://ftp.debian.org/debian bookworm-proposed-updates InRelease
Сущ:5 https://ftp.debian.org/debian bookworm-backports InRelease
Чтение списков пакетов... Готово           
Построение дерева зависимостей... Готово
Чтение информации о состоянии... Готово         
Может быть обновлён 21 пакет. Запустите «apt list --upgradable» для показа.
N: Репозиторий «Debian bookworm» изменил значение поля «firmware component» с «non-free» на «non-free-firmware»
N: Дополнительные сведения об этом можно найти в «Информации о выпуске» по адресу: https://www.debian.org/releases/bookworm/amd64/release-notes/ch-information.html#non-free-split
noscow@Tovaristch:~$


[свернуть]

nos, как вам здесь уже написали, прежде чем затевать что-то грандиозное как новичку сначала надо научиться сохранять то что было так дорого установленно и настроено. Для этого надо немного читать форум прежде чем влазить во все тяжкие (и главное сначала думать а потом делать), научиться делать образы рабочей и настроенной системы это первостепенная необходимость не только для linux, этот навык избавит вас от 90% проблем и сэкономит кучу времени и нервов.
Там внизу ↓

Да, понимаю, что часто ленюсь изучить инструкции с достаточной педантичностью.
А хранить резервные копии системы я перестал, когда вскоре после первого знакомства с Линуксом Таймшифт сожрал всё дисковое пространство чуть ли не до килобайта Видимо, надо с ним подружиться наконец.
В целом в планах есть изучение работы системы на более низком уровне, вопрос во времени на это обычно.

Ну и как итог:
Проблема решилась, когда я остановил работу dpkg из-под рута, а после этого проделал указанные выше в теме манипуляции, включая sudo dpkg -r libcifpp-data.
Сейчас apt upgrade идёт без ошибок, в данных о системе указана последняя версия, всем спасибо за помощь!

[koshak83]

Вывод полный

Код Выделить Развернуть

sudo apt update

Кинул под спойлер:

Открыть содержимое (спойлер)

Код Выделить Развернуть

noscow@Tovaristch:~$ sudo apt update
[sudo] пароль для noscow:
Сущ:1 https://ftp.debian.org/debian bookworm InRelease
Пол:2 https://ftp.debian.org/debian bookworm-updates InRelease [52,1 kB]
Пол:3 https://ftp.debian.org/debian bookworm-proposed-updates InRelease [59,5 kB]       
Пол:4 https://security.debian.org/debian-security bookworm-security InRelease [48,0 kB]
Пол:5 https://ftp.debian.org/debian bookworm-backports InRelease [56,5 kB]
Пол:6 https://ftp.debian.org/debian bookworm-proposed-updates/main amd64 Packages.diff/Index [63,3 kB]
Пол:7 https://ftp.debian.org/debian bookworm-proposed-updates/main Translation-en.diff/Index [63,3 kB]
Пол:8 https://ftp.debian.org/debian bookworm-proposed-updates/main amd64 Packages T-2024-01-20-2028.17-F-2024-01-20-2028.17.pdiff [15,4 kB]
Пол:8 https://ftp.debian.org/debian bookworm-proposed-updates/main amd64 Packages T-2024-01-20-2028.17-F-2024-01-20-2028.17.pdiff [15,4 kB]
Пол:9 https://ftp.debian.org/debian bookworm-backports/main amd64 Packages.diff/Index [63,3 kB]
Пол:10 https://ftp.debian.org/debian bookworm-backports/main Translation-en.diff/Index [53,2 kB]
Пол:11 https://ftp.debian.org/debian bookworm-proposed-updates/main Translation-en T-2024-01-20-2028.17-F-2024-01-20-2028.17.pdiff [9 647 B]
Пол:11 https://ftp.debian.org/debian bookworm-proposed-updates/main Translation-en T-2024-01-20-2028.17-F-2024-01-20-2028.17.pdiff [9 647 B]
Пол:12 https://ftp.debian.org/debian bookworm-backports/main amd64 Packages T-2024-01-21-2005.55-F-2024-01-20-2028.17.pdiff [1 589 B]
Пол:12 https://ftp.debian.org/debian bookworm-backports/main amd64 Packages T-2024-01-21-2005.55-F-2024-01-20-2028.17.pdiff [1 589 B]
Пол:13 https://ftp.debian.org/debian bookworm-backports/main Translation-en T-2024-01-20-2028.17-F-2024-01-20-2028.17.pdiff [151 B]
Пол:13 https://ftp.debian.org/debian bookworm-backports/main Translation-en T-2024-01-20-2028.17-F-2024-01-20-2028.17.pdiff [151 B]
Получено 486 kB за 1с (458 kB/s)
Чтение списков пакетов... Готово
Построение дерева зависимостей... Готово
Чтение информации о состоянии... Готово         
Может быть обновлён 21 пакет. Запустите «apt list --upgradable» для показа.
N: Репозиторий «Debian bookworm» изменил значение поля «firmware component» с «non-free» на «non-free-firmware»
N: Дополнительные сведения об этом можно найти в «Информации о выпуске» по адресу: https://www.debian.org/releases/bookworm/amd64/release-notes/ch-information.html#non-free-split
noscow@Tovaristch:~$

После выполнения

Код Выделить Развернуть

sudo dpkg -r libcifpp-data

Стало:

Код Выделить Развернуть

noscow@Tovaristch:~$ sudo apt update
Сущ:1 https://security.debian.org/debian-security bookworm-security InRelease
Сущ:2 https://ftp.debian.org/debian bookworm InRelease
Сущ:3 https://ftp.debian.org/debian bookworm-updates InRelease
Сущ:4 https://ftp.debian.org/debian bookworm-proposed-updates InRelease
Сущ:5 https://ftp.debian.org/debian bookworm-backports InRelease
Чтение списков пакетов... Готово           
Построение дерева зависимостей... Готово
Чтение информации о состоянии... Готово         
Может быть обновлён 21 пакет. Запустите «apt list --upgradable» для показа.
N: Репозиторий «Debian bookworm» изменил значение поля «firmware component» с «non-free» на «non-free-firmware»
N: Дополнительные сведения об этом можно найти в «Информации о выпуске» по адресу: https://www.debian.org/releases/bookworm/amd64/release-notes/ch-information.html#non-free-split
noscow@Tovaristch:~$


[свернуть]

nos, как вам здесь уже написали, прежде чем затевать что-то грандиозное как новичку сначала надо научиться сохранять то что было так дорого установленно и настроено. Для этого надо немного читать форум прежде чем влазить во все тяжкие (и главное сначала думать а потом делать), научиться делать образы рабочей и настроенной системы это первостепенная необходимость не только для linux, этот навык избавит вас от 90% проблем и сэкономит кучу времени и нервов.
Там внизу ↓

Да, понимаю, что часто ленюсь изучить инструкции с достаточной педантичностью.
А хранить резервные копии системы я перестал, когда вскоре после первого знакомства с Линуксом Таймшифт сожрал всё дисковое пространство чуть ли не до килобайта Видимо, надо с ним подружиться наконец.
В целом в планах есть изучение работы системы на более низком уровне, вопрос во времени на это обычно.

Ну и как итог:
Проблема решилась, когда я остановил работу dpkg из-под рута, а после этого проделал указанные выше в теме манипуляции, включая sudo dpkg -r libcifpp-data.
Сейчас apt upgrade идёт без ошибок, в данных о системе указана последняя версия, всем спасибо за помощь!

Чтобы Timeshift не сожрал всё дисковое пространство отключите автоматический режим и создавайте резервные копии по запросу сами вручную когда собираетесь делать с системой что-то важное, удаляя предыдущие копии данных.