Тогда остаётся проверить опцию отключения активирования скринсейвера при работе VLC (опция VLC).
Если не помогает (а скорее всего это так, т.к. она вроде должна быть активирована по умолчанию, но всё же лучше проверить), то пишите в багтрекер на эту ошибку. И не забудьте указать какой у вас скринсейвер.